从梦妖魔制造的梦境中醒来，已经是日上三竿了。
“真是个幸福的梦呢！”小智想起了一些梦境的碎片化的记忆。
小智还想多想起一些梦里的事情，却被小刚的声音叨扰了！
“啊啊啊啊！我的乔伊小姐呢！君莎小姐～也不见了！”
小刚崩溃的蜷缩在草地上！
小刚：这样的现实，我不能接受！
“小刚，你怎么了？”
小智刚准备起身去看一下小刚的情况，结果右手就摸到了地上的一个神奇宝贝球。
“这是......”
［梦妖魔，魔法神奇宝贝，梦妖的进化型，会吟咏咒文折磨对手，但据说也会咏唱蕴藏着让对手变得幸福的咒文，是神出鬼没的神奇宝贝。］
小智收起了神奇宝贝图鉴，虽然不知道发生了什么，但是......
“我收服梦妖魔了！”
“哈？睡一觉就有神奇宝贝送上门，还有这种事吗？”
小光作为新手训练家，还是第一次遇到这种事。
“波加曼，我们也继续睡觉吧！”
“波加！”
“不要再搞怪了，如果真能这样的话，那么这个世界上最强的神奇宝贝训练家绝对就会是卡比兽了！”
小刚义正言辞的说道，如果忽视掉他咕咕叫的肚子的话！
“咕咕～”
好像引起了连锁反应，小智和小光的肚子也叫了起来。
“前面好像有长有树果的森林，我们快过去吧！”
小刚手上拿着一张地图，指着一个方向说道。
小智等人渐行渐远，完全没有注意到在离他们不远的地方，火箭队的两人一猫还被困在了梦妖魔制造的梦境里，一边在地上打滚，一边喃喃的说着“好讨厌的感觉！”。
帷幕市。
在郊外的森林里，刚抵达帷幕市的小智等人就遇到了帷幕市的道馆训练家——阿李。
此时的阿李正在跟一个路卡利欧战斗。
这让小智立刻就有了兴趣，于是停下来观摩这场战斗。
不过这时，又忽然冒出来一个电击兽对皮卡丘和波加曼恶作剧，三只神奇宝贝很快就真的“打成了一片”。
三只神奇宝贝的战斗立即引起了阿李和路卡利欧的注意。
“路卡利欧，快阻止他们！”
阿李的路卡利欧直接扔过去一个“波导弹”！
“快住手！”小智着急的喊道。
不过跟小智想象的不一样，被“波导弹”命中的三个神奇宝贝只是晕过去了而已。
小智：吓死我了，不过......真的是好弱的波导弹啊！
看到安然无恙的皮卡丘，小智松了口气。
“路卡利欧，快点道歉啊！”
“路卡！”
“什么！你说能只是稍微聚气而已！”
阿李和路卡利欧的对话让小智恍然大悟，怪不得这个“波导弹”这么弱，原来是没有用全力。
“阿李，发生什么事了？”
又有一个青年跑了过来。
互相结识了之后，小智也知道了两个人的身份和名字，道馆训练家阿李，还有真司的哥哥雷司。
不过就在小智提出要进行道馆对战的时候，小李却拒绝了。
原来是因为阿李在跟真司进行神奇宝贝战斗的时候，被真司打击了自信，阿李觉得自己并没有作为道馆训练家的资格，所以才拒绝了小智。
虽然暂时不能和阿李战斗，但雷司却对小智发起了挑战。
而为了让阿李恢复自信，小光开启了自己的第一次道馆赛。
在跟小光的对战中，阿李重新找回了属于神奇宝贝对战的乐趣所在，再次立志作为一个合格的道馆训练家，努力打好跟每一挑战者的的道馆比赛。
而现在，就是阿李重新振作后的第一次比赛！
“出场吧！豪力！”
面对阿李的豪力，小智派出了飞行系的姆克鸟。
借由“电光一闪”带来的速度，加上属性的克制，姆克鸟的“回转攻”瞬间打败了阿李的豪力。
“去吧！玛沙那！”
阿李的玛沙那连续使用“先决”躲避了姆克鸟的攻击，然后趁机使用“瑜伽姿势”叠加起了攻击力。
叠完了攻击力的玛沙那先后用念力让小智的姆克鸟和小火焰猴陷入混乱之中。
但因为小智作为挑战者可以更换神奇宝贝，所以两个神奇宝贝都被小智收回了神奇宝贝球里，并不会算作淘汰。
小火焰猴陷入混乱之后，小智又把在神奇宝贝球里解除了混乱的姆克鸟派了出来。
在姆克鸟刚学会的“神鸟特攻”，加上之前小火焰猴对玛沙那累积的伤害之下，阿李的玛沙那失去了战斗能力。
第三个神奇宝贝，阿李毫不意外地派出了她最强的路卡利欧。
先后解决了姆克鸟和小火焰猴，路卡利欧和小智的勇气鼬展开了最后的对决！
波导弹和水波动的对撞不断的出现在道馆对战场上，阿李的路卡利欧最终和小智的勇气鼬打了个平手。
得到了道馆徽章，小智等人再次踏上旅程。
在某个山岳地区，小智等人遇到了一个黑蓝相间的神奇宝贝。
“是利欧路！最近总是能遇到这种神奇宝贝呢！”
“小智你看，牠好像受伤了！”
听到小刚的话，小智也注意到了利欧路的伤势，赶紧跑过去想帮牠治疗，不过却遭到了警惕的利欧路的攻击。
这时，一个神秘的少年忽然出现，救下了被攻击的小智。
而出现的神秘少年，正是专门为了把利欧路带回故乡的首席神奇宝贝保育家创一。
不过就在创一救下小智的功夫，利欧路趁机就跑进了森林里。
小智和神秘少年追了上去，却遇到了准备抓捕利欧路的神奇宝贝猎人J和她的手下。
J是神奇宝贝猎人，一个非法盗猎神奇宝贝的组织的头目。
小智跟她也打过几次交道了。
盗猎团人多势众，加上J强大的暴蝾螈（暴飞龙），小智等人根本不是对手。
“快，跑进森林里去！”创一抱着已经信任了小智等人的利欧路，一马当先的跑进了森林之中。
不过小智等人还是小看了J的凶狠，虽然茂密的森林可以阻碍了暴飞龙的视野，但J根本才不会管什么森林不森林的，直接命令暴飞龙四处使用“破坏死光”，燃起了森林大火。
森林里的神奇宝贝可是骚乱起来每个神奇宝贝都慌张的四处奔逃。
“快去有水源的地方！”创一大声的喊道。
不仅是为了避火，有水源的地方一般会有水系的神奇宝贝，如果有能使用“求雨”的神奇宝贝，身为保育家的创一就可以指挥牠们使出“求雨”熄灭这场森林大火。
“暴蝾螈，使用破坏死光！”
J骑在暴蝾螈的背上，拦在了小智等人面前，“破坏死光”也阻断了小智等人的逃跑之路。
大火越烧越旺，小智和森林里的神奇宝贝也陷入了危机之中。
“可恶，我绝对不会原谅你的！”
不过小智也就只能说说而已了。
“波加曼，使用求雨！”
“波加？”
波加曼歪了歪头，看了眼小光：你认真的？
“完蛋了，波加曼根本不会求雨，我还没有成为顶级的宝可梦协调训练家，就要在这里结束了吗？”
然而就在这时，天空中忽然乌云密布，瓢泼般的雨水从天而降！
“波加曼，你太棒了，你竟然会求雨了耶！”
小光把波加曼抱在怀里，原地转起了圈。
“波加？波加！”
“什么？你说不是你做的？你太谦虚了，波加曼，除了你还有谁能用求雨呢！”
这里只有波加曼一只水属性的神奇宝贝，不是波加曼还能是谁呢！
“波加！”
就在小智等人为这场雨开心的时候，J却如临大敌一样，指挥着暴蝾螈使出了破坏死光！
小智正要准备指挥神奇宝贝挡下这一招，却发现暴蝾螈的破坏死光的攻击目标根本不在这边。
暴蝾螈的破坏死光从小智等人头顶穿过，打在了小智等人身后。
浓烟散去，鹿云的身影终于显露了出来！
“是路卡利欧！”小智兴奋的喊道。
“对啊，都快把小智你的路卡利欧给忘掉了！”小刚也松了口气。
鹿云抬手对着天上的暴蝾螈，然后手轻轻地往下一按，暴蝾螈就砸到了地面上。
“是超能力系的念力！可为什么路卡利欧也能用？”创一疑惑的说道。
“快飞起来啊！你这个废物！”
J站在暴蝾螈的背上，使劲的用脚踢着暴蝾螈。
不过很快她的动作就停了下来。
“怎么会这样，救......”
话音未落，J的身体就开始慢慢变成了一块石头！
而这时，暴蝾螈也终于如她的意愿飞了起来，可变成石头的J却没办法站稳在暴蝾螈的身上，直接从暴蝾螈背上跌了下来！
解决了麻烦，鹿云再次消失，自己回到了神奇宝贝球里。
“好厉害，小智你竟然还有这么厉害的神奇宝贝！”小光崇拜的说道。
“哈哈，哪有啦，再怎么说我也是橘子联盟的名誉训练家，石英大会的......”
小智“谦虚”的把自己的战绩在小光面前说了一遍。