今天，tpc总部收到恐龙研究中心的报警，说是挖到了一具结冰的恐龙化石，要求胜利队过去调查。
于是大古和崛井开车来到恐龙研究中心。一名研究员告诉崛井和大古，这次发现的恐龙化石，属于距今1亿3500万年到6500万年的白垩纪时期的恐龙，和一种塔波特的恐龙非常相似。
两人被带到化石前面，看到巨大的恐龙化石，也是发出一阵惊呼。
“哇，好大啊！”
“实在大的惊人！”
“真是不敢相信啊！”
在一番观察后。两人更加难以置信。原来这只恐龙竟然做过生化电子手术！
这怎么可能！
就在两人还在震惊的时候，tpc总部却被强烈的电磁波所笼罩。在一阵电闪雷鸣之后，tpc总部的整个系统都断了。
就在众人不知所措时，屏幕却自动亮了起来，并发出声音，还出现一艘巨大的宇宙飞船。
原来是那伽人在搞鬼！
那伽人自称是宇宙之神，还郑重的警告人类，说地球今后将归他们那伽人统治！如果有谁敢违抗，就会将其消灭。
一番大言不惭的讲话，可见那伽人是多么自大！
大古和崛井原本收到总部的通知让他俩马上回去，结果刚走到外面，雷达显示电子恐龙出现巨大能量反应。
于是两人重新返回电子恐龙处，结果中途有一名女子对他俩发动了攻击，而这女子正是唤醒电子恐龙的人。
在打斗过程中，崛井一枪击中那名女子，女子昏迷了过去，不过在昏迷前按下了控制器，将电子恐龙释放。
大古和崛井并不知道电子恐龙即将苏醒，只是带着女子回到总部进行治疗。
就在大古他们回去没多久，电子恐龙丸迫奈扎苏醒了过来，并发出声音：“我们那伽人曾经统治过地球上的恐龙，丸迫奈扎就是最好的证明！”
总部众人看到屏幕中的生化电子恐龙也是一脸震惊。
此时总部系统得到了修复，泽井总监也发来视频。要求胜利队对付侵略者。
于是居间惠命令胜利队全体出动！
众人驾驶两架飞燕号，对着丸迫奈扎就是一顿激光发射，可惜并没有对电子恐龙造成任何有效的伤害。
此时，丸迫奈扎来到城市边缘，再次发出警告：要求人类在一个小时内投降，否则丸迫奈扎就会再次醒来，发动连续攻击，直到将人类全部消灭为止。
胜利队趁机开始对电子恐龙内部进行扫描，结果发现电子恐龙内部有一颗中子弹！
而这么大一颗中子弹，万一爆炸的话，地球上至少一半的生物将遭到毁灭！
……另一边，大古带着女子在研究中心进行检查。结果发现这位少女与白垩纪时期的一种叫特异龙的恐龙拥有相同的dNA。
此时，恐龙少女醒了过来，并劫持了真由美。
其实恐龙少女早就醒了，她听到了崛井的谈话。她原本非常信任那伽人，但如今听到丸迫奈扎体内有中子弹，难以接受。
此时崛井假装跟恐龙少女说话，然后冲了上去，救下真由美。
恐龙少女见机逃走，而大古追了出去。
大古一边追恐龙少女，一边大喊着劝说恐龙少女。
少女有点被大古说动了。但少女的同伴阿达姆此时却从门后走出。
“伊舞不要被他骗了，人类都是一些花言巧语的生物，不要相信他们！”
“你又是谁！”本来那少女就要被他说动了，结果出来个搅局的，大古气道。
阿达姆一番自我介绍，原来他是经由那伽人之手进化成功的第一个恐龙人。
阿达姆说完就伸出爪子向大古发动攻击。
大古左躲右闪，避开所有攻击，此时有其他警备人员到来，开枪击中阿达姆面部。阿达姆的脸被打破，露出了恐龙人的皮肤。
阿达姆逃到天台，准备开启丸迫奈扎，可惜没有成功。
于是阿达姆联系宇宙中的那伽人，那伽人用意念回应了阿达姆，让其复活丸迫奈扎2号。随后阿达姆启动丸迫奈扎2号开始对城市进行破坏！
大古和伊舞来到天台开始劝说阿达姆。一番动之以情，晓之以理后，阿达姆听了伊舞的话，开始尝试将丸迫奈扎2号停下来。结果丸迫奈扎2号不受他控制。
阿达姆有点崩溃，因为他意识到那伽人真的在欺骗他们！
此时，2号丸迫奈扎正在向1号前进。
原来当两头怪兽靠在一起时，中子弹就会爆炸。这就是那伽人的阴谋。
杨光看到这里，突然有了一个想法，就是将两只怪兽体内的中子弹取出，扔到那伽人飞船上引爆。
“哈，我真是个天才，我的智力虽然没有点在发明上，但点在了战术上。”杨光自豪的心想。
“大古，能听到吗，我准备将怪兽体内的中子弹取出来，然后扔到那伽人的飞船上，到时我们发射光线引爆中子弹，将那伽人和他的飞船一同销毁。我来取丸迫奈扎2号体内的中子弹，你去取1号的。”杨光用奥特念力与大古交流道。
“明白！”大古回答。
杨光来到没有人的地方，掏出神光棒变身为盖德奥特曼出场。
看到丸迫奈扎2号开始向1号前进，二话不说上去就是一个正蹬，将其踹倒在地。
为什么总是这招先起手！
盖德也很无语，因为对方不还手，一心想要和1号合体，身体直接往前送，本能就出脚了。
那伽人看到有奥特曼阻扰，知道不解决这个奥特曼，无法让1号和2号合体，于是命令丸迫奈扎2号攻击盖德奥特曼。
说实话，机械恐龙丸迫奈扎的力量非常强，而且防御很高，要是迪迦的话估计又要被捶。可对战的是盖德，那就不一样了。
盖德对着丸迫奈扎2号就是一顿攻击，然而丸迫奈扎2号虽然不断的被盖德打倒在地，可是受到的伤害不高，防御高得确实没话说。
盖德眼看平A不起作用，于是将光能蓄力到右手，整个右手和小臂都发出光芒。蓄力轰击在丸迫奈扎2号的头部，将整个头打碎。丸迫奈扎2号此时终于失去行动能力。
盖德徒手取出中子弹。
大古那边也变身为迪迦，顺利取出中子弹。
两奥点头确认，飞上太空来到那伽人的飞船附近。同时将中子弹扔出，两奥开始蓄力，又同时发出光线，将中子弹引爆。巨大的爆炸使那伽人和他的飞船都化成了碎片。
在这么大的爆炸下，那伽人肯定无法存活！
两奥返回地面变成人间体的模样。来到两位恐龙人面前。
“你们可以留下来在地球生活。因为你们本来就是地球种族。希望我们可以和平相处。”杨光说道。
“不了，我们差点酿成大错毁灭地球，没有资格生活在这里了。”阿达姆说道。
“我们恐龙人会找到一个新的家园。”伊舞也说道。
“再见盖德奥特曼，迪迦奥特曼！谢谢你们保护了地球。”阿达姆和伊舞同时说道。
然后变成恐龙人的真面目，召唤出飞船离开了地球。