自来也从火影办公室室离开后，因为担心长门他们，便急匆匆的向雨忍村赶去，以他的实力没过多久便来到了雨忍村外，此时他虽然很想快点见到长门，但做为忍者这么多年，他还是控制住了自己的情绪。没有贸然进入雨忍村。
之前他从妙木山蛤蟆一族那得到长门他们的一些情报，并且联络过他们，让他们也加入围攻流星的行动，只不过在行动中长门被流星说服，没有人出手，但当时自来也是看到过天道佩恩的，自来也不明白弥彦怎么会拥有轮回眼的，而且看的出弥彦他们跟自己好像有佷大的隔阂，因为至始至终弥彦并没有和做为老师的他说话，这佷不符合弥彦的性格，自来也觉得要弄清楚这些。不过从三代火影的情报中知道在不久前那个之前在围攻流星时出现的拥有一只写轮眼的面具男夺走了漩涡长门的一只轮回眼，这让自来也有些困惑难不成会有两双轮回眼？而且是弥彦和长门？自来也知道这是不可能的。总之这一刻自来也心中充满了疑惑。
想不清，自来也便按下心头的疑惑，因为他知道要弄清这些，只要找到长门他们就可以了，于是他小心翼翼的潜入了雨忍村之中，本如果漩涡长门没有丢失一颗轮回眼，以他的能力一但有外村的忍者进入雨忍村，他便可以立刻发现，但此时他不但因为丢失了一颗轮回眼导致实力下降了很多，同时因为切断了与外道魔像的联系，需要养伤，虽然也因为只有一颗轮回眼减轻了身体的负担，加上或许是因为长时间供应轮回眼的缘故，让他的漩涡一族血脉得到了进化，在丢失了一颗轮回眼后，显现了出来，拥有了强大的恢复能力，短短几天便让他那严重的伤势得到了恢复，看样子用不了多久便可以完全的恢复，而且漩涡长门发现他拥有了强大的感知，不是轮回眼带来的，他明白这是漩涡一族的神乐心眼，也正因为如此让他稍稍放心了点，这些天小南看到漩涡长门身体的恢复心里很开心，只是漩涡长门身上宇智波斑留下的暗手，虽然很快就被他们俩发现在心脏处，但他们俩完全没有办法去除，这让他们佷是担心，在加上那个宇智波带土的能力，让他们防备起来很是被动，好在不知道什么原因，那些家伙并没有再行动。就在这样情况下自来也悄无声息潜入到了雨忍村的中心地带，也在这时漩涡长门感知到了他的到来。
“小南，小心有人潜入了村子。”漩涡长门站起来对小南说道。
“是那个宇智波带土吗？”小南问道。
“应该不是，也不是绝和晓组织的人，让我看看，咦，是自来也老师，他怎么会在这个时候来这？”漩涡长门疑惑道。
“自来也老师？他来这儿干什么？难道是要再次联合晓组织对付星海帝国的元首，长门我们要见自来也老师吗？”小南迟疑道。
“不管自来也老师怀着什么目的来这，既然自来也老师找上门来了，我们是躲不过的，还是先见一见他好了，看他怎么说。”漩涡长门说道。
“对，先见见自来也老师，说不定自来也老师能够去除宇智波斑留在你身上的暗手。”小南说道。
俩人决定后便向自来也所在赶去，很快他们就出现在了自来也面前，就这样师徒三人再次相见了。