前面改的差不多了，可以看了
败给小茂并从他口中得知神奥地区的存在后，小智决定前往神奥地区，于是短暂休息后再次从真新镇出发。小智原本打算和上次前往丰缘地区时一样只主蛇是一只蛇形的宝可梦。它的身体背部为深绿色，腹部则是浅绿色。进化后的君主蛇失去了后肢，前肢退化只剩下小小的叶子手，尾巴末端附近长出了三片深绿色的叶子。它的身上有着黄色的花纹，如同皇家的高贵纹路一般。脖子附近的两个卷开的叶藤，就像西装的领子袖口，内部为黄色。君主蛇的眼睛是红色的，透露着不屑，给人一种高贵又盛气的感觉。
君主蛇拥有能让对手畏惧的眼神和威风凛凛的样子，会抬高头颅威吓对方，因此被称为森林的君主。它仅仅是盯着，就能令对手动弹不得。它只会对那些即使被它高贵的眼眸盯着也毫不畏惧的强大对手动真格。它能将由阳光制造出的能量在长长的身体内增强至原本的数十倍。带着皮卡丘前往新地区，但是他的长尾怪手偷偷地跟上了小智所乘坐的船，于是小智发现后也将它纳入了旅行的队伍。虽然小刚一开始并没有跟随小智前往神奥地区，但两个人很快就在神奥地区再次相遇并结伴同行。除了雷吉艾勒奇:“雷艾~雷艾~”
雷吉铎拉戈:“雷吉哦~”
雷吉奇卡斯:“唔吼！”
巨钳螳螂:“厚沙！”
达克莱伊:“dAR！”
具甲武者:“吾夏！”
大嘴娃:“伊吼！”
黑鲁加:“啊呜~”
超能妙喵（雄):“呜喵~”
超能妙喵（雌):“妙克~”
胡地:“胡恰~”
沙奈朵:“唔嗯~”
苍炎刃鬼:“唔烘！”
劈斧螳螂:“伊呀！”
小次郎的宝可梦:沙漠奈亚、卡蒂狗（小卡)、班基拉斯
武藏的宝可梦:三首恶龙、果然翁
小刚的宝可梦:不良蛙、大钢蛇、九尾、惊角鹿、幸福蛋
小霞的宝可梦:水伊布、可达鸭、牛蛙君、暴鲤龙
小智和小霞的女儿:沫沫静静
小智和莎莉娜的女儿:浅浅、烟烟小刚外，小智还结识了另一名宝可梦协调训在波克比是谁的呢!?中，小智一行人在旅途中来到某座城市的宝可梦中心。吃饭的时候，小智一行人谈论起了在大傻谷得到的宝可梦的蛋，一旁火箭队偷听到这个消息，然后趁机抢走了这枚蛋。小智一行人在找到火箭队时，喵喵正在照顾着蛋。在双方争夺蛋的时候，蛋孵化了，原来这是波克比的蛋。之后为了争夺波克比，小智、小霞、小刚、喵喵进行了比赛。但波克比把出生时第一眼看到的人当做父母，因此波克比把小霞当成了它的母亲，所以小霞获得波克比。直到在超世代的出现，小霞的怀里基本上都一直抱着波克比。练家小光。就像对待小遥一样，小智也很支持小光挑战华丽大赛。此外，，所以就寄回去华蓝道馆了。
在华蓝道馆！水中的战斗！中，小霞的墨海马似乎因为缺乏运动而身体不适，因此小霞决定顺路回一趟家。到了华蓝市，小智一行人发现华蓝道馆要举办水中芭蕾，而主角由小霞来扮演。小霞勉为其难接受了主角的工作。另外，火箭队准备在水中芭蕾表演时夺取水属性宝可梦。在火箭队抢夺宝可梦时，小智他们击败了火箭队，并且小霞的小海狮进化成了白海狮。由于小霞的姐姐们的要求，小霞把她的宝石海星寄放在了华蓝道馆；而墨海马由于需要休养，也暂存在华蓝道馆中。
在再见可达鸭！又来了哥达鸭？中，在小智还申请了一个神奥地区的华丽大赛参加证。
在神奥地区，小智遇到了一位实力强劲的劲敌真司。在小智的旅途中，他与真司多次相遇，两人在宝可梦训练上完全相反的风格致使他们产生了矛盾。真司对待自己的宝可梦严厉且苛刻，有些时候甚至很残忍。真司认为宝可梦的实力是第一位的，凡是在战斗能力上不能令他满意的宝可梦，他会选择放生；而小智则认为训练宝可梦的最佳方法是通过耐心、关爱、友情和尊重。真司对小智的言论不以为然，因为小智的关爱和友情并没有给小智带来更多的胜利。在家缘市的家缘大会中，小智和真司阴差阳错地组成了搭，，，。。。。。