接下来船队在瓦尔德斯半岛南部280斯塔狄亚的圣克鲁斯河河口再次留了2000人下来建立了一个定居点，接着没多久就来到了一段地形非常复杂的海峡（麦哲伦海峡），其可怕之处主要体现在其恶劣的天气条件、狭窄的水道以及复杂的潮流和风向变化。
这里位于南美洲大陆最南端，由火地岛等岛屿围合而成，海峡蜿蜒曲折，长592千米，最窄处仅有3.3千米，最宽处却有32千米左右。这里的天气条件极为恶劣，长期受到偏西大风和风暴的影响，尤其是在每年9月中旬至来年3月盛行西南风，10月至11月份风力较大，风浪通常在早晨起风，下午随日落风力逐渐减弱。幸亏现在是八月份，风浪还不算太大。
此外，麦哲伦海峡的潮流和风向变化复杂，主航道内的流向受潮水影响，流向多变，航经有河口交叉的航段时要注意流压差影响。这些因素共同作用，使得麦哲伦海峡成为南大西洋与南太平洋之间最重要的天然航道，但由于是逆风航行，风大浪高，航道狭窄，岛屿众多，航线不明，航道曲折，很难航行。
麦哲伦海峡的暗礁和浅滩是由于其地理位置和地质构造形成的。海峡两侧的山地形成的显着狭管效应使得西风风力得以加强，风大浪高。此外，海峡曲折狭长，多暗礁和浅滩，当受西风吹拂的海流经过时不断受到阻隔，导致逆流和漩涡的产生。
帕特罗克勒斯欣赏了一个月的峡湾风光才从海峡中出来，火地岛的原住民雅甘人是一个也没见到。通过四分仪和罗盘，他发现他们已经穿过了这个大陆，至于南面什么情况只能以后另外派人去探索了。
他带领舰队继续北上并时不时地派人到陆地上探查情况，终于发现了有人类活动的痕迹，生活在这里的正是马普切人，马普切人一副生人勿近的状态让人很难前去沟通，最后还是采用先送礼再沟通的办法，和他们取得了联系。帕特罗克勒斯在南纬47°西经74°的一个海湾（佩纳斯湾）处建了一个小镇，就以马普切人的族名命名，留下了3000人，和两艘船只。
由于帝国子民的善意，马普切人对这些新来的人也表现出了善意和好奇。他们进入村庄，看到了很多新鲜事物，在了解到他们喜欢黄白之物后，纷纷拿着白银和纯铜前来交易，看到大船，也有想上去参观的，对此，新移民都是来者不拒。他们也希望把他们融入进来，为建设美好的家园增加劳力。
接下来的路程，帕特罗克勒斯发现沿海地区几乎都是沙漠戈壁，这和当年在南部非洲的西海岸同纬度航行的时候的地貌是差不多的，加上之前在巴西东海岸和非洲东南部也都是类似气候，再加上北纬25-35°和南纬25-35°的气候也是非常接近，这让他得出了同纬度且南北纬地区的大陆东西岸气候极为类似的结论。这个发现让他兴奋不已，仔细记录了数据，并要求以后的航海人员一定要在航海时详细记录气候和环境变化。
随着一路向北航行了半个月后，舰队来到了南纬33°的一个地方，这里居住着马普切人的一个大部落，这里的马普切人家里有很多纯铜铸成的各式生活用品和武器。带着向导询问之后得知，他们都是从北面的部落里面交易得来的。帕特罗克勒斯不知道的是这里以北1050公里和1300公里以外分别有世界上最大的埃斯康迪达铜矿和丘基卡马塔铜矿两个巨大的露天铜矿。其中，埃斯康迪达铜矿有大量伴生金矿和银矿，丘基卡马塔铜矿有伴生金矿。不过埃斯康迪达铜矿埋藏在底下几百米，很难开采，但丘基卡马塔铜矿却是世界上最大的露天铜矿，以现在的技术，多少年都开采不完。
智利地区还有被称为“魔鬼矿山”的拉科塔巴尔帕金矿和北萨拉雷斯金矿，都是非常难以开采的金矿。智利也就丘基卡马塔铜矿中的伴生金银矿好开采一些。相对来说，秘鲁的黄金储量更丰富，中部的安卡什地区的金矿是露天金矿，南部的阿雷基帕的金矿不是露天的，北部卡哈马卡地区的金矿是露天地下都有，储量最丰富。
不过帕特罗克勒斯对这些一无所知，这里的马普切人也不知道，但生活在沙漠（阿塔卡玛沙漠）那头的印第安人知道，秘鲁的印加人也知道，帕特罗克勒斯拿出了大量青铜武器和铠甲，获得了当地的马普切人的支持，留下8000人在此建城，取名为菲利卡波勒（Φiλik?Π?λη），意为“朋友的城市”，随后带着马普切人乘着海船杀向沙漠那边去。
由于秘鲁寒流的关系，这里的沙漠是世界上最干旱的地方之一，但在这长达两千多公里的沿海沙漠地带，智利北部的阿塔卡玛沙漠是最干旱的，但这里却蕴藏着极其丰富的铜矿和硝石矿，同时也拥有不少数量的金矿。智利安托法加斯塔省的附近的丘基卡马塔铜矿就是这些原始土着所使用的金银铜的主要来源。
在塔拉帕卡大区伊基克城东48公里处的潘帕斯沙漠地区，这里由200多个采矿点组成，形成了世界上最大的硝石堆积地。硝石矿中主要是硝酸钠和硝酸钾，既是制作火药的重要原料，又是制作肥料的重要原料。
帕特罗克勒斯带着2000马普切人沿着海岸线一路往北，碰到村庄就下来盘问，并把一些知情人士带上船继续北上，虽然很少有村庄部落，但一路的寻觅还是让他们摸到了一些踪迹。在船队来到南纬22°左右的海岸边的时候，帕特罗克勒斯率领2000帝国士兵和2000马普切人下了船，他们深入内陆，再次抓了一些土着，终于来到了传说中的金矿所在地。
在这个时代，马普切人根本没有想过能跑一千多公里远来到这个沙漠深处，因为无论食物、水源和对此地环境的认知都足以限制这些部落的行动了，毕竟这里是世界上最干旱的地方，大队人马远行一不当心就会全军覆没。
但对于亚历山大帝国的军人来说，穿越沙漠也不是一两回了，带着大量的饮水和骆驼可以轻易穿过这不算太宽的沙漠，经过七天七夜的行军，众人终于来到了丘基卡马塔铜矿所在的位置，这里有几百号人在挖矿，众人被帕特罗克勒斯这阵势吓得瑟瑟发抖。
通过了解，他们正是生活在东面附近安第斯山下的土着人，他们所居住的部落就在东面10帕拉桑的距离外。虽然哪怕带来的向导和他们的语言也有所区别，但拥有绝对的武力就拥有了最强大的话语权，对于一个人口三四千人的部落，四千装备精良的战士对他们而言是碾压的局面。而且部落之间长期的贸易，土着与土着之间也比较容易沟通。
很快军队就带着他们回到了部落，帕特罗克勒斯宣布铜矿为亚历山大帝国所有，但本地的土着可以进行开采，帝国将会全部进行收购，不过居民需要缴税，但事实上土着人所获得的更多，因为帕特罗克勒斯一行人的到来，完全改变了他们的生活方式。他们带来了数不尽的各种物资，全是这些交通闭塞的土着从来没有见过的。
帕特罗克勒斯宣布将这些人纳入帝国治下的子民，享有待遇则是给他们建造了一些公共设施，如警务局、学堂、医院、公共厕所、市场、寺庙等，还教会了他们盖房子，因为这里的人都是睡的草窝，就算有些屋子是用木头撑起来的，顶上也都是用草覆盖的，就是草屋棚子。他们能够开采铜矿已经是十分了不起的成就了。
不过在经过帕特罗克勒斯的一顿整改之后，无论是马普切人和这些土着人都震惊了，他们十分感恩戴德，帕特罗克勒斯为了保住这块大型铜矿产地，安排了一些人居住在这里，不过人数很少，警察二三十个，医生两个，教师五个外加几个向导马普切人，还有几十个人在此贩卖商品物资。也好在附近有着发源于奥坎基尔查山的洛阿河通过，给本地的居民和矿区的工人提供了水源，否在这个水原问题绝对是限制居民生存的大问题。
为了预防叛乱，帕特罗克勒斯在这里留了500帝国军人和500马普切人，在附近单独筑了个小的堡垒，并给与了马普切士兵每日3个奥波的待遇。而部落的男人，大部分都被安排去开矿了，帕特罗克勒斯留下一些懂得开矿的希腊人指导开采。也有一千左右的马普切人愿意留下开采，帕特罗克勒斯让他们负责金矿的分离和熔炼，待遇比这里的土着人要好一些。
由于是露天铜金矿，所以工人只需要采用台阶式剥离法直接一层层地剥离覆盖在矿体上的土壤和岩石，露出矿体后进行矿石开采，然后粉碎矿石之后进行煅烧烘烤，最后是去除杂质，把金银分离出来。为了节省劳动力，加快开采效率，帕特罗克勒斯直接在河边建造了不少水利工坊，专门用来敲击矿石，然后在旁边建造了熔炼场，帕特罗克勒斯后续会安排人运送煤炭过来。
另外还挖了一条渠通往矿区用于冲刷矿体用，通过冲刷可以很快辨别出含金或者含铜的矿石（冲洗法），同时也可以更方便地将矿石运输到河边。另外，铁铲和铁镐的数量则完全足够，因为殖民活动必然涉及开发矿山，所以这些工具足有几十万把，那些移民基本一家就有一两把。但其实开矿的损耗率会很大，所以还要在这里配一个铁匠铺。
帕特罗克勒斯在这里直接建了一个小镇，建了大量的房屋，然后搞了个船厂，大量地打造用于内河航运的小船，因为洛阿河的流量非常小，不仅是海船，就算大一点的船只都难以通行，只能行驶一百吨以下的小船。不仅需要它们用于运输矿石，还需要他们运输提炼好的金银铜运到沿海。
于是，回去的时候，军队就沿着洛阿河一路向沿海地区行军，到了海边再让人骑着骆驼迅速向南跑回登陆点通知船队接人。而他们也在洛阿河的河口建立了一个海港城市，在这留下了1000人。
这次行程花费了两个月左右，这时候已经是公元前309年的11月，他安排船只送剩下的马普切人回到菲利卡波勒。给两边都留下了些船后再次开启了北上之旅，而接下来他将来到美洲三大文明发源地的秘鲁地区。